Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamp3Q7TST5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp3Q7TST5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamp3Q7TST5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms