Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ClmQ7TSN2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ClmQ7TSN2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ClmQ7TSN2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ClmQ7TSN2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms