Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20,29■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,29■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20,27■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20,27■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20,26■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20,26■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20,26■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20,25■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20,23■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20,23■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20,23■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,22■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,22■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20,21■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
ScocQ78YZ6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,18■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20,18■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20,16■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20,16■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,15■□□□□ 0,82
ScocQ78YZ6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20,14■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20,14■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20,14■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,14■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,13■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,13■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,13■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20,11■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,11■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20,1■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,09■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
ScocQ78YZ6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20,09■□□□□ 0,81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,9 ms