Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,08■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18,08■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,07■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,07■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18,06■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,06■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,05■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18,04■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18,04■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18,04■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,04■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,03■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,03■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,48
Vma21Q78T54 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,01■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,01■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17,99■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17,98■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17,98■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17,98■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17,98■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,97■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,97■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,97■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,97■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,97■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,97■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17,97■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17,97■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17,97■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,96■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17,96■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17,96■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,96■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Vma21Q78T54 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,95■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17,95■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,95■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
Vma21Q78T54 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms