Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SpopQ6ZWS8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SpopQ6ZWS8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms