Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Syne2Q6ZWQ0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Syne2Q6ZWQ0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Syne2Q6ZWQ0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms