Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nemp1Q6ZQE4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nemp1Q6ZQE4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nemp1Q6ZQE4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nemp1Q6ZQE4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms