Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg5Q6ZPY2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg5Q6ZPY2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg5Q6ZPY2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg5Q6ZPY2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg5Q6ZPY2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg5Q6ZPY2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg5Q6ZPY2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg5Q6ZPY2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg5Q6ZPY2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg5Q6ZPY2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg5Q6ZPY2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg5Q6ZPY2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg5Q6ZPY2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg5Q6ZPY2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg5Q6ZPY2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg5Q6ZPY2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg5Q6ZPY2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg5Q6ZPY2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg5Q6ZPY2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg5Q6ZPY2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smg5Q6ZPY2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Smg5Q6ZPY2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smg5Q6ZPY2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg5Q6ZPY2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg5Q6ZPY2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg5Q6ZPY2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms