Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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