Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIE5

Atp1a2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a2Q6PIE5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp1a2Q6PIE5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1a2Q6PIE5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1a2Q6PIE5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1a2Q6PIE5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1a2Q6PIE5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1a2Q6PIE5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1a2Q6PIE5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1a2Q6PIE5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1a2Q6PIE5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp1a2Q6PIE5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp1a2Q6PIE5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp1a2Q6PIE5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp1a2Q6PIE5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1a2Q6PIE5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1a2Q6PIE5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1a2Q6PIE5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1a2Q6PIE5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp1a2Q6PIE5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1a2Q6PIE5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atp1a2Q6PIE5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp1a2Q6PIE5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1a2Q6PIE5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1a2Q6PIE5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1a2Q6PIE5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1a2Q6PIE5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1a2Q6PIE5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1a2Q6PIE5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1a2Q6PIE5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1a2Q6PIE5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1a2Q6PIE5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1a2Q6PIE5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1a2Q6PIE5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1a2Q6PIE5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1a2Q6PIE5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1a2Q6PIE5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1a2Q6PIE5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1a2Q6PIE5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1a2Q6PIE5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp1a2Q6PIE5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp1a2Q6PIE5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp1a2Q6PIE5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp1a2Q6PIE5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1a2Q6PIE5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1a2Q6PIE5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1a2Q6PIE5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1a2Q6PIE5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1a2Q6PIE5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1a2Q6PIE5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1a2Q6PIE5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1a2Q6PIE5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1a2Q6PIE5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1a2Q6PIE5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1a2Q6PIE5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1a2Q6PIE5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1a2Q6PIE5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1a2Q6PIE5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms