Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HjurpQ6PG16 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HjurpQ6PG16 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HjurpQ6PG16 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HjurpQ6PG16 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HjurpQ6PG16 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HjurpQ6PG16 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HjurpQ6PG16 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HjurpQ6PG16 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HjurpQ6PG16 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HjurpQ6PG16 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HjurpQ6PG16 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HjurpQ6PG16 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HjurpQ6PG16 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HjurpQ6PG16 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HjurpQ6PG16 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HjurpQ6PG16 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HjurpQ6PG16 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HjurpQ6PG16 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms