Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad54bQ6PFE3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad54bQ6PFE3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad54bQ6PFE3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad54bQ6PFE3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad54bQ6PFE3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad54bQ6PFE3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rad54bQ6PFE3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad54bQ6PFE3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad54bQ6PFE3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms