Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85bQ6PDY0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc85bQ6PDY0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc85bQ6PDY0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc85bQ6PDY0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc85bQ6PDY0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc85bQ6PDY0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc85bQ6PDY0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc85bQ6PDY0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc85bQ6PDY0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc85bQ6PDY0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85bQ6PDY0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85bQ6PDY0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85bQ6PDY0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc85bQ6PDY0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ccdc85bQ6PDY0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ccdc85bQ6PDY0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms