Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarcc2Q6PDG5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarcc2Q6PDG5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarcc2Q6PDG5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarcc2Q6PDG5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarcc2Q6PDG5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarcc2Q6PDG5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarcc2Q6PDG5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarcc2Q6PDG5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarcc2Q6PDG5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarcc2Q6PDG5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarcc2Q6PDG5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarcc2Q6PDG5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarcc2Q6PDG5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarcc2Q6PDG5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarcc2Q6PDG5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarcc2Q6PDG5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarcc2Q6PDG5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarcc2Q6PDG5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarcc2Q6PDG5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarcc2Q6PDG5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarcc2Q6PDG5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarcc2Q6PDG5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Smarcc2Q6PDG5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarcc2Q6PDG5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarcc2Q6PDG5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarcc2Q6PDG5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarcc2Q6PDG5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarcc2Q6PDG5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarcc2Q6PDG5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarcc2Q6PDG5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarcc2Q6PDG5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarcc2Q6PDG5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarcc2Q6PDG5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarcc2Q6PDG5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarcc2Q6PDG5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarcc2Q6PDG5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarcc2Q6PDG5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarcc2Q6PDG5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarcc2Q6PDG5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarcc2Q6PDG5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarcc2Q6PDG5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarcc2Q6PDG5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarcc2Q6PDG5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarcc2Q6PDG5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarcc2Q6PDG5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarcc2Q6PDG5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarcc2Q6PDG5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarcc2Q6PDG5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarcc2Q6PDG5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarcc2Q6PDG5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarcc2Q6PDG5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarcc2Q6PDG5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarcc2Q6PDG5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarcc2Q6PDG5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarcc2Q6PDG5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarcc2Q6PDG5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarcc2Q6PDG5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarcc2Q6PDG5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarcc2Q6PDG5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarcc2Q6PDG5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms