Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB44

Ptpn23, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23, mousemouse

Predictions only

Length 1,692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn23Q6PB44 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Ptpn23Q6PB44 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29,63■■■□□ 2,33
Ptpn23Q6PB44 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29,62■■■□□ 2,33
Ptpn23Q6PB44 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Ptpn23Q6PB44 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29,6■■■□□ 2,33
Ptpn23Q6PB44 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29,6■■■□□ 2,33
Ptpn23Q6PB44 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Ptpn23Q6PB44 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Ptpn23Q6PB44 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Ptpn23Q6PB44 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Ptpn23Q6PB44 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Ptpn23Q6PB44 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Ptpn23Q6PB44 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Ptpn23Q6PB44 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Ptpn23Q6PB44 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Ptpn23Q6PB44 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Ptpn23Q6PB44 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Ptpn23Q6PB44 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Ptpn23Q6PB44 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Ptpn23Q6PB44 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Ptpn23Q6PB44 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Ptpn23Q6PB44 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Ptpn23Q6PB44 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Ptpn23Q6PB44 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Ptpn23Q6PB44 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Ptpn23Q6PB44 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Ptpn23Q6PB44 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Ptpn23Q6PB44 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29,53■■■□□ 2,32
Ptpn23Q6PB44 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Ptpn23Q6PB44 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Ptpn23Q6PB44 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Ptpn23Q6PB44 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Ptpn23Q6PB44 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Ptpn23Q6PB44 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Ptpn23Q6PB44 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Ptpn23Q6PB44 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Ptpn23Q6PB44 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Ptpn23Q6PB44 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Ptpn23Q6PB44 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Ptpn23Q6PB44 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
Ptpn23Q6PB44 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29,49■■■□□ 2,31
Ptpn23Q6PB44 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Ptpn23Q6PB44 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Ptpn23Q6PB44 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Ptpn23Q6PB44 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Ptpn23Q6PB44 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Ptpn23Q6PB44 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Ptpn23Q6PB44 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Ptpn23Q6PB44 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Ptpn23Q6PB44 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Ptpn23Q6PB44 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Ptpn23Q6PB44 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Ptpn23Q6PB44 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Ptpn23Q6PB44 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Ptpn23Q6PB44 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Ptpn23Q6PB44 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Ptpn23Q6PB44 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Ptpn23Q6PB44 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Ptpn23Q6PB44 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Ptpn23Q6PB44 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29,45■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Ptpn23Q6PB44 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Ptpn23Q6PB44 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29,38■■■□□ 2,29
Ptpn23Q6PB44 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Ptpn23Q6PB44 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Ptpn23Q6PB44 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Ptpn23Q6PB44 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Ptpn23Q6PB44 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Ptpn23Q6PB44 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Ptpn23Q6PB44 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Ptpn23Q6PB44 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Ptpn23Q6PB44 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Ptpn23Q6PB44 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Ptpn23Q6PB44 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Ptpn23Q6PB44 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Ptpn23Q6PB44 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,4 ms