Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Prkab2Q6PAM0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prkab2Q6PAM0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prkab2Q6PAM0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prkab2Q6PAM0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prkab2Q6PAM0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prkab2Q6PAM0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prkab2Q6PAM0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prkab2Q6PAM0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prkab2Q6PAM0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prkab2Q6PAM0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prkab2Q6PAM0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prkab2Q6PAM0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prkab2Q6PAM0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Prkab2Q6PAM0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prkab2Q6PAM0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prkab2Q6PAM0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prkab2Q6PAM0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prkab2Q6PAM0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prkab2Q6PAM0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prkab2Q6PAM0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prkab2Q6PAM0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prkab2Q6PAM0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Prkab2Q6PAM0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prkab2Q6PAM0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prkab2Q6PAM0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prkab2Q6PAM0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prkab2Q6PAM0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prkab2Q6PAM0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prkab2Q6PAM0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prkab2Q6PAM0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prkab2Q6PAM0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Prkab2Q6PAM0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Prkab2Q6PAM0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prkab2Q6PAM0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prkab2Q6PAM0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prkab2Q6PAM0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms