Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mvb12bQ6KAU4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mvb12bQ6KAU4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mvb12bQ6KAU4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mvb12bQ6KAU4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mvb12bQ6KAU4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mvb12bQ6KAU4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mvb12bQ6KAU4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mvb12bQ6KAU4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mvb12bQ6KAU4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mvb12bQ6KAU4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mvb12bQ6KAU4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mvb12bQ6KAU4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Mvb12bQ6KAU4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms