Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn11Q6J756 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn11Q6J756 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn11Q6J756 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 473.3 ms