Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cep78Q6IRU7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep78Q6IRU7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep78Q6IRU7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms