Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Nckap5lQ6GQX2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nckap5lQ6GQX2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nckap5lQ6GQX2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nckap5lQ6GQX2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nckap5lQ6GQX2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nckap5lQ6GQX2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nckap5lQ6GQX2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nckap5lQ6GQX2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nckap5lQ6GQX2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nckap5lQ6GQX2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nckap5lQ6GQX2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nckap5lQ6GQX2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nckap5lQ6GQX2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nckap5lQ6GQX2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Nckap5lQ6GQX2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nckap5lQ6GQX2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nckap5lQ6GQX2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nckap5lQ6GQX2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nckap5lQ6GQX2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Nckap5lQ6GQX2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nckap5lQ6GQX2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nckap5lQ6GQX2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nckap5lQ6GQX2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Nckap5lQ6GQX2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Nckap5lQ6GQX2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nckap5lQ6GQX2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nckap5lQ6GQX2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nckap5lQ6GQX2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nckap5lQ6GQX2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nckap5lQ6GQX2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nckap5lQ6GQX2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nckap5lQ6GQX2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nckap5lQ6GQX2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nckap5lQ6GQX2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nckap5lQ6GQX2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nckap5lQ6GQX2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nckap5lQ6GQX2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nckap5lQ6GQX2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nckap5lQ6GQX2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nckap5lQ6GQX2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nckap5lQ6GQX2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nckap5lQ6GQX2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nckap5lQ6GQX2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Nckap5lQ6GQX2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nckap5lQ6GQX2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nckap5lQ6GQX2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nckap5lQ6GQX2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nckap5lQ6GQX2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nckap5lQ6GQX2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nckap5lQ6GQX2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nckap5lQ6GQX2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Nckap5lQ6GQX2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nckap5lQ6GQX2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nckap5lQ6GQX2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nckap5lQ6GQX2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nckap5lQ6GQX2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nckap5lQ6GQX2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nckap5lQ6GQX2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nckap5lQ6GQX2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nckap5lQ6GQX2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nckap5lQ6GQX2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nckap5lQ6GQX2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nckap5lQ6GQX2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nckap5lQ6GQX2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nckap5lQ6GQX2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Nckap5lQ6GQX2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Nckap5lQ6GQX2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nckap5lQ6GQX2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Nckap5lQ6GQX2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Nckap5lQ6GQX2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms