Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep290Q6A078 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep290Q6A078 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep290Q6A078 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cep290Q6A078 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cep290Q6A078 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cep290Q6A078 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cep290Q6A078 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cep290Q6A078 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cep290Q6A078 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cep290Q6A078 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cep290Q6A078 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep290Q6A078 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep290Q6A078 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep290Q6A078 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep290Q6A078 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep290Q6A078 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep290Q6A078 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep290Q6A078 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep290Q6A078 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cep290Q6A078 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cep290Q6A078 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep290Q6A078 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep290Q6A078 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep290Q6A078 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep290Q6A078 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep290Q6A078 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep290Q6A078 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep290Q6A078 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep290Q6A078 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep290Q6A078 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep290Q6A078 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep290Q6A078 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep290Q6A078 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep290Q6A078 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep290Q6A078 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep290Q6A078 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cep290Q6A078 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cep290Q6A078 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cep290Q6A078 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cep290Q6A078 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cep290Q6A078 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cep290Q6A078 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cep290Q6A078 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep290Q6A078 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep290Q6A078 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep290Q6A078 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep290Q6A078 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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