Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cep170Q6A065 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Cep170Q6A065 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Cep170Q6A065 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Cep170Q6A065 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cep170Q6A065 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cep170Q6A065 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cep170Q6A065 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cep170Q6A065 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cep170Q6A065 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cep170Q6A065 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cep170Q6A065 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cep170Q6A065 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cep170Q6A065 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Cep170Q6A065 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cep170Q6A065 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cep170Q6A065 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Cep170Q6A065 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Cep170Q6A065 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Cep170Q6A065 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cep170Q6A065 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cep170Q6A065 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cep170Q6A065 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cep170Q6A065 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Cep170Q6A065 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Cep170Q6A065 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Cep170Q6A065 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Cep170Q6A065 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Cep170Q6A065 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Cep170Q6A065 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Cep170Q6A065 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Cep170Q6A065 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Cep170Q6A065 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Cep170Q6A065 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Cep170Q6A065 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cep170Q6A065 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cep170Q6A065 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Cep170Q6A065 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cep170Q6A065 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cep170Q6A065 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cep170Q6A065 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Cep170Q6A065 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cep170Q6A065 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Cep170Q6A065 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cep170Q6A065 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cep170Q6A065 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cep170Q6A065 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cep170Q6A065 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cep170Q6A065 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cep170Q6A065 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cep170Q6A065 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.45■■■■□ 3.26
Cep170Q6A065 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cep170Q6A065 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cep170Q6A065 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cep170Q6A065 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cep170Q6A065 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cep170Q6A065 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Cep170Q6A065 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cep170Q6A065 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cep170Q6A065 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cep170Q6A065 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cep170Q6A065 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cep170Q6A065 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Cep170Q6A065 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Cep170Q6A065 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Cep170Q6A065 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cep170Q6A065 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Cep170Q6A065 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cep170Q6A065 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Cep170Q6A065 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cep170Q6A065 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cep170Q6A065 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cep170Q6A065 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cep170Q6A065 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cep170Q6A065 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cep170Q6A065 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.9 ms