Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pdzrn3Q69ZS0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdzrn3Q69ZS0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdzrn3Q69ZS0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdzrn3Q69ZS0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pdzrn3Q69ZS0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pdzrn3Q69ZS0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Pdzrn3Q69ZS0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pdzrn3Q69ZS0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pdzrn3Q69ZS0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pdzrn3Q69ZS0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdzrn3Q69ZS0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdzrn3Q69ZS0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdzrn3Q69ZS0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdzrn3Q69ZS0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdzrn3Q69ZS0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdzrn3Q69ZS0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdzrn3Q69ZS0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pdzrn3Q69ZS0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pdzrn3Q69ZS0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pdzrn3Q69ZS0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pdzrn3Q69ZS0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdzrn3Q69ZS0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdzrn3Q69ZS0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdzrn3Q69ZS0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pdzrn3Q69ZS0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pdzrn3Q69ZS0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pdzrn3Q69ZS0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdzrn3Q69ZS0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdzrn3Q69ZS0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdzrn3Q69ZS0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdzrn3Q69ZS0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pdzrn3Q69ZS0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pdzrn3Q69ZS0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pdzrn3Q69ZS0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pdzrn3Q69ZS0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pdzrn3Q69ZS0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pdzrn3Q69ZS0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pdzrn3Q69ZS0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pdzrn3Q69ZS0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdzrn3Q69ZS0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdzrn3Q69ZS0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdzrn3Q69ZS0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pdzrn3Q69ZS0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Pdzrn3Q69ZS0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdzrn3Q69ZS0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdzrn3Q69ZS0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdzrn3Q69ZS0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
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