Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zcchc2Q69ZB8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zcchc2Q69ZB8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zcchc2Q69ZB8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zcchc2Q69ZB8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zcchc2Q69ZB8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zcchc2Q69ZB8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Zcchc2Q69ZB8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zcchc2Q69ZB8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zcchc2Q69ZB8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zcchc2Q69ZB8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zcchc2Q69ZB8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zcchc2Q69ZB8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Zcchc2Q69ZB8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zcchc2Q69ZB8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zcchc2Q69ZB8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Zcchc2Q69ZB8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zcchc2Q69ZB8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zcchc2Q69ZB8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zcchc2Q69ZB8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zcchc2Q69ZB8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zcchc2Q69ZB8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zcchc2Q69ZB8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zcchc2Q69ZB8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zcchc2Q69ZB8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zcchc2Q69ZB8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zcchc2Q69ZB8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zcchc2Q69ZB8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms