Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrcc1Q69ZB0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrcc1Q69ZB0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrcc1Q69ZB0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrcc1Q69ZB0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrcc1Q69ZB0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrcc1Q69ZB0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrcc1Q69ZB0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrcc1Q69ZB0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrcc1Q69ZB0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrcc1Q69ZB0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrcc1Q69ZB0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrcc1Q69ZB0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrcc1Q69ZB0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms