Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Sptbn2Q68FG2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Sptbn2Q68FG2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sptbn2Q68FG2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sptbn2Q68FG2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sptbn2Q68FG2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sptbn2Q68FG2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptbn2Q68FG2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptbn2Q68FG2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptbn2Q68FG2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptbn2Q68FG2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptbn2Q68FG2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptbn2Q68FG2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptbn2Q68FG2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptbn2Q68FG2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptbn2Q68FG2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptbn2Q68FG2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptbn2Q68FG2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptbn2Q68FG2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptbn2Q68FG2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptbn2Q68FG2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptbn2Q68FG2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sptbn2Q68FG2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sptbn2Q68FG2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sptbn2Q68FG2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sptbn2Q68FG2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms