Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4fQ66X05 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4fQ66X05 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4fQ66X05 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4fQ66X05 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4fQ66X05 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4fQ66X05 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4fQ66X05 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4fQ66X05 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp4fQ66X05 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp4fQ66X05 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp4fQ66X05 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp4fQ66X05 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlrp4fQ66X05 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp4fQ66X05 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nlrp4fQ66X05 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms