Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ca4Q64444 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ca4Q64444 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ca4Q64444 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms