Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf4Q64287 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf4Q64287 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf4Q64287 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf4Q64287 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irf4Q64287 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf4Q64287 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.4 ms