Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Defa17Q64016 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa17Q64016 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa17Q64016 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms