Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp1Q62442 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vamp1Q62442 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp1Q62442 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms