Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim27Q62158 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim27Q62158 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim27Q62158 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim27Q62158 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim27Q62158 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim27Q62158 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim27Q62158 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim27Q62158 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim27Q62158 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim27Q62158 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim27Q62158 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim27Q62158 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim27Q62158 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim27Q62158 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim27Q62158 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim27Q62158 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim27Q62158 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim27Q62158 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim27Q62158 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim27Q62158 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim27Q62158 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim27Q62158 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Trim27Q62158 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim27Q62158 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Trim27Q62158 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim27Q62158 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim27Q62158 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Trim27Q62158 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trim27Q62158 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim27Q62158 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Trim27Q62158 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim27Q62158 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Trim27Q62158 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim27Q62158 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Trim27Q62158 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim27Q62158 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Trim27Q62158 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trim27Q62158 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Trim27Q62158 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Trim27Q62158 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trim27Q62158 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trim27Q62158 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim27Q62158 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim27Q62158 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim27Q62158 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim27Q62158 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Trim27Q62158 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim27Q62158 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim27Q62158 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Trim27Q62158 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trim27Q62158 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim27Q62158 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim27Q62158 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim27Q62158 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim27Q62158 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim27Q62158 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim27Q62158 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim27Q62158 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim27Q62158 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim27Q62158 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim27Q62158 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim27Q62158 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim27Q62158 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim27Q62158 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim27Q62158 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim27Q62158 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim27Q62158 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim27Q62158 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim27Q62158 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim27Q62158 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Trim27Q62158 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trim27Q62158 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trim27Q62158 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trim27Q62158 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.9 ms