Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3bQ62141 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sin3bQ62141 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms