Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pabpc2Q62029 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc2Q62029 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pabpc2Q62029 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc2Q62029 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms