Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EsrrbQ61539 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EsrrbQ61539 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EsrrbQ61539 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EsrrbQ61539 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EsrrbQ61539 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EsrrbQ61539 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EsrrbQ61539 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EsrrbQ61539 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EsrrbQ61539 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EsrrbQ61539 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EsrrbQ61539 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EsrrbQ61539 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EsrrbQ61539 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EsrrbQ61539 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EsrrbQ61539 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EsrrbQ61539 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EsrrbQ61539 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EsrrbQ61539 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EsrrbQ61539 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EsrrbQ61539 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EsrrbQ61539 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EsrrbQ61539 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EsrrbQ61539 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EsrrbQ61539 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EsrrbQ61539 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EsrrbQ61539 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EsrrbQ61539 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EsrrbQ61539 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EsrrbQ61539 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EsrrbQ61539 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EsrrbQ61539 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EsrrbQ61539 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EsrrbQ61539 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EsrrbQ61539 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EsrrbQ61539 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EsrrbQ61539 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EsrrbQ61539 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EsrrbQ61539 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EsrrbQ61539 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EsrrbQ61539 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EsrrbQ61539 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EsrrbQ61539 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EsrrbQ61539 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EsrrbQ61539 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EsrrbQ61539 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EsrrbQ61539 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms