Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itm2aQ61500 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itm2aQ61500 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itm2aQ61500 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itm2aQ61500 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itm2aQ61500 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itm2aQ61500 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itm2aQ61500 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itm2aQ61500 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Itm2aQ61500 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itm2aQ61500 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itm2aQ61500 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itm2aQ61500 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itm2aQ61500 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itm2aQ61500 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Itm2aQ61500 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Itm2aQ61500 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itm2aQ61500 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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