Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ift88Q61371 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift88Q61371 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ift88Q61371 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ift88Q61371 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift88Q61371 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift88Q61371 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ift88Q61371 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ift88Q61371 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ift88Q61371 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ift88Q61371 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ift88Q61371 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ift88Q61371 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ift88Q61371 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ift88Q61371 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ift88Q61371 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ift88Q61371 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ift88Q61371 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ift88Q61371 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ift88Q61371 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ift88Q61371 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ift88Q61371 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ift88Q61371 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ift88Q61371 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ift88Q61371 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms