Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BcanQ61361 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
BcanQ61361 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BcanQ61361 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BcanQ61361 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BcanQ61361 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BcanQ61361 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BcanQ61361 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BcanQ61361 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BcanQ61361 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BcanQ61361 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BcanQ61361 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BcanQ61361 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BcanQ61361 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BcanQ61361 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BcanQ61361 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BcanQ61361 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BcanQ61361 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BcanQ61361 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BcanQ61361 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BcanQ61361 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BcanQ61361 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BcanQ61361 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BcanQ61361 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BcanQ61361 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BcanQ61361 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BcanQ61361 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BcanQ61361 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BcanQ61361 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BcanQ61361 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BcanQ61361 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BcanQ61361 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BcanQ61361 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BcanQ61361 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BcanQ61361 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BcanQ61361 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BcanQ61361 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BcanQ61361 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BcanQ61361 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BcanQ61361 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
BcanQ61361 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BcanQ61361 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BcanQ61361 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BcanQ61361 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BcanQ61361 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BcanQ61361 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BcanQ61361 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BcanQ61361 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BcanQ61361 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
BcanQ61361 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BcanQ61361 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BcanQ61361 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BcanQ61361 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
BcanQ61361 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BcanQ61361 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BcanQ61361 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BcanQ61361 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BcanQ61361 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BcanQ61361 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BcanQ61361 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BcanQ61361 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BcanQ61361 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BcanQ61361 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BcanQ61361 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BcanQ61361 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BcanQ61361 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BcanQ61361 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BcanQ61361 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
BcanQ61361 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BcanQ61361 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BcanQ61361 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BcanQ61361 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BcanQ61361 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BcanQ61361 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BcanQ61361 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BcanQ61361 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BcanQ61361 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BcanQ61361 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
BcanQ61361 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BcanQ61361 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BcanQ61361 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BcanQ61361 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BcanQ61361 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BcanQ61361 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BcanQ61361 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BcanQ61361 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BcanQ61361 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BcanQ61361 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BcanQ61361 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BcanQ61361 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
BcanQ61361 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BcanQ61361 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BcanQ61361 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BcanQ61361 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BcanQ61361 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BcanQ61361 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BcanQ61361 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BcanQ61361 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BcanQ61361 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BcanQ61361 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms