Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ift20Q61025 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ift20Q61025 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ift20Q61025 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift20Q61025 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift20Q61025 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift20Q61025 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift20Q61025 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ift20Q61025 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ift20Q61025 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift20Q61025 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift20Q61025 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift20Q61025 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift20Q61025 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift20Q61025 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift20Q61025 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift20Q61025 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift20Q61025 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift20Q61025 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift20Q61025 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift20Q61025 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift20Q61025 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift20Q61025 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift20Q61025 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift20Q61025 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift20Q61025 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift20Q61025 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift20Q61025 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift20Q61025 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift20Q61025 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift20Q61025 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift20Q61025 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift20Q61025 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ift20Q61025 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ift20Q61025 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ift20Q61025 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ift20Q61025 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ift20Q61025 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift20Q61025 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift20Q61025 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ift20Q61025 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ift20Q61025 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ift20Q61025 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ift20Q61025 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ift20Q61025 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ift20Q61025 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ift20Q61025 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ift20Q61025 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ift20Q61025 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ift20Q61025 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ift20Q61025 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift20Q61025 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms