Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Atf3Q60765 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Atf3Q60765 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Atf3Q60765 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Atf3Q60765 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Atf3Q60765 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Atf3Q60765 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Atf3Q60765 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Atf3Q60765 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Atf3Q60765 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Atf3Q60765 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Atf3Q60765 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Atf3Q60765 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Atf3Q60765 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Atf3Q60765 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Atf3Q60765 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Atf3Q60765 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Atf3Q60765 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Atf3Q60765 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Atf3Q60765 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Atf3Q60765 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Atf3Q60765 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Atf3Q60765 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Atf3Q60765 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Atf3Q60765 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Atf3Q60765 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Atf3Q60765 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Atf3Q60765 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Atf3Q60765 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Atf3Q60765 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Atf3Q60765 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Atf3Q60765 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Atf3Q60765 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Atf3Q60765 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Atf3Q60765 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Atf3Q60765 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Atf3Q60765 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Atf3Q60765 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Atf3Q60765 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Atf3Q60765 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Atf3Q60765 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Atf3Q60765 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Atf3Q60765 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Atf3Q60765 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Atf3Q60765 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Atf3Q60765 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Atf3Q60765 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Atf3Q60765 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Atf3Q60765 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Atf3Q60765 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Atf3Q60765 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Atf3Q60765 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Atf3Q60765 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Atf3Q60765 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Atf3Q60765 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Atf3Q60765 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Atf3Q60765 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Atf3Q60765 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Atf3Q60765 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Atf3Q60765 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Atf3Q60765 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Atf3Q60765 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Atf3Q60765 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Atf3Q60765 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Atf3Q60765 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Atf3Q60765 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Atf3Q60765 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Atf3Q60765 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Atf3Q60765 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Atf3Q60765 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Atf3Q60765 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Atf3Q60765 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Atf3Q60765 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Atf3Q60765 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Atf3Q60765 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Atf3Q60765 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Atf3Q60765 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Atf3Q60765 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Atf3Q60765 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Atf3Q60765 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Atf3Q60765 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Atf3Q60765 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Atf3Q60765 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Atf3Q60765 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Atf3Q60765 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Atf3Q60765 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Atf3Q60765 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Atf3Q60765 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Atf3Q60765 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Atf3Q60765 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Atf3Q60765 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Atf3Q60765 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Atf3Q60765 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Atf3Q60765 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Atf3Q60765 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Atf3Q60765 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Atf3Q60765 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Atf3Q60765 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Atf3Q60765 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Atf3Q60765 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms