Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ClpbQ60649 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ClpbQ60649 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClpbQ60649 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClpbQ60649 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClpbQ60649 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClpbQ60649 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ClpbQ60649 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ClpbQ60649 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ClpbQ60649 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ClpbQ60649 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClpbQ60649 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClpbQ60649 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ClpbQ60649 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ClpbQ60649 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ClpbQ60649 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ClpbQ60649 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms