Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CttnQ60598 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CttnQ60598 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CttnQ60598 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CttnQ60598 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CttnQ60598 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CttnQ60598 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CttnQ60598 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CttnQ60598 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CttnQ60598 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CttnQ60598 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CttnQ60598 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CttnQ60598 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CttnQ60598 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CttnQ60598 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CttnQ60598 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CttnQ60598 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CttnQ60598 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CttnQ60598 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CttnQ60598 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CttnQ60598 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CttnQ60598 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CttnQ60598 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CttnQ60598 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CttnQ60598 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CttnQ60598 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CttnQ60598 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CttnQ60598 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CttnQ60598 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CttnQ60598 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CttnQ60598 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CttnQ60598 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CttnQ60598 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CttnQ60598 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms