Protein–RNA interactions for Protein: Q5YD48

A1cf, APOBEC1 complementation factor, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1cfQ5YD48 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
A1cfQ5YD48 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A1cfQ5YD48 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A1cfQ5YD48 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A1cfQ5YD48 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
A1cfQ5YD48 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25■■□□□ 1.59
A1cfQ5YD48 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25■■□□□ 1.59
A1cfQ5YD48 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A1cfQ5YD48 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
A1cfQ5YD48 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A1cfQ5YD48 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A1cfQ5YD48 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A1cfQ5YD48 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A1cfQ5YD48 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A1cfQ5YD48 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A1cfQ5YD48 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A1cfQ5YD48 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A1cfQ5YD48 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A1cfQ5YD48 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A1cfQ5YD48 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A1cfQ5YD48 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A1cfQ5YD48 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
A1cfQ5YD48 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A1cfQ5YD48 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
A1cfQ5YD48 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
A1cfQ5YD48 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms