Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFR0

Pabpn1l, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1lQ5XFR0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pabpn1lQ5XFR0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pabpn1lQ5XFR0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpn1lQ5XFR0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms