Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc125Q5U465 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc125Q5U465 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms