Protein–RNA interactions for Protein: Q5U430

Ubr3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr3Q5U430 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ubr3Q5U430 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ubr3Q5U430 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ubr3Q5U430 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ubr3Q5U430 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ubr3Q5U430 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ubr3Q5U430 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ubr3Q5U430 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ubr3Q5U430 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ubr3Q5U430 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ubr3Q5U430 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ubr3Q5U430 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ubr3Q5U430 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ubr3Q5U430 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ubr3Q5U430 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ubr3Q5U430 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ubr3Q5U430 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubr3Q5U430 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubr3Q5U430 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ubr3Q5U430 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ubr3Q5U430 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ubr3Q5U430 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ubr3Q5U430 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ubr3Q5U430 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ubr3Q5U430 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ubr3Q5U430 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ubr3Q5U430 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ubr3Q5U430 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ubr3Q5U430 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ubr3Q5U430 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ubr3Q5U430 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ubr3Q5U430 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ubr3Q5U430 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ubr3Q5U430 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ubr3Q5U430 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ubr3Q5U430 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ubr3Q5U430 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ubr3Q5U430 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ubr3Q5U430 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ubr3Q5U430 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ubr3Q5U430 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ubr3Q5U430 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ubr3Q5U430 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ubr3Q5U430 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ubr3Q5U430 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ubr3Q5U430 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ubr3Q5U430 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ubr3Q5U430 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ubr3Q5U430 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ubr3Q5U430 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ubr3Q5U430 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ubr3Q5U430 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ubr3Q5U430 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ubr3Q5U430 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ubr3Q5U430 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Ubr3Q5U430 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ubr3Q5U430 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ubr3Q5U430 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ubr3Q5U430 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ubr3Q5U430 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubr3Q5U430 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubr3Q5U430 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Ubr3Q5U430 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ubr3Q5U430 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms