Protein–RNA interactions for Protein: Q5U419

Mfsd3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd3Q5U419 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mfsd3Q5U419 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mfsd3Q5U419 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mfsd3Q5U419 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mfsd3Q5U419 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms