Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ssh2Q5SW75 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ssh2Q5SW75 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ssh2Q5SW75 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ssh2Q5SW75 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Ssh2Q5SW75 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
Ssh2Q5SW75 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ssh2Q5SW75 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ssh2Q5SW75 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ssh2Q5SW75 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ssh2Q5SW75 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ssh2Q5SW75 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ssh2Q5SW75 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ssh2Q5SW75 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ssh2Q5SW75 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ssh2Q5SW75 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ssh2Q5SW75 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ssh2Q5SW75 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ssh2Q5SW75 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Ssh2Q5SW75 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ssh2Q5SW75 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ssh2Q5SW75 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ssh2Q5SW75 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Ssh2Q5SW75 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ssh2Q5SW75 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ssh2Q5SW75 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ssh2Q5SW75 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ssh2Q5SW75 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ssh2Q5SW75 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Ssh2Q5SW75 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ssh2Q5SW75 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ssh2Q5SW75 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Ssh2Q5SW75 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ssh2Q5SW75 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Ssh2Q5SW75 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ssh2Q5SW75 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ssh2Q5SW75 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ssh2Q5SW75 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ssh2Q5SW75 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ssh2Q5SW75 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ssh2Q5SW75 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ssh2Q5SW75 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ssh2Q5SW75 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ssh2Q5SW75 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ssh2Q5SW75 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ssh2Q5SW75 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ssh2Q5SW75 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Ssh2Q5SW75 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ssh2Q5SW75 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ssh2Q5SW75 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ssh2Q5SW75 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ssh2Q5SW75 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ssh2Q5SW75 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ssh2Q5SW75 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ssh2Q5SW75 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ssh2Q5SW75 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ssh2Q5SW75 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ssh2Q5SW75 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ssh2Q5SW75 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ssh2Q5SW75 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ssh2Q5SW75 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ssh2Q5SW75 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ssh2Q5SW75 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ssh2Q5SW75 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ssh2Q5SW75 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Ssh2Q5SW75 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ssh2Q5SW75 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ssh2Q5SW75 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ssh2Q5SW75 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ssh2Q5SW75 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ssh2Q5SW75 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ssh2Q5SW75 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ssh2Q5SW75 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Ssh2Q5SW75 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ssh2Q5SW75 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ssh2Q5SW75 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms