Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PfasQ5SUR0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PfasQ5SUR0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PfasQ5SUR0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PfasQ5SUR0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PfasQ5SUR0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PfasQ5SUR0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PfasQ5SUR0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PfasQ5SUR0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PfasQ5SUR0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PfasQ5SUR0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PfasQ5SUR0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PfasQ5SUR0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PfasQ5SUR0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PfasQ5SUR0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PfasQ5SUR0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PfasQ5SUR0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PfasQ5SUR0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PfasQ5SUR0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PfasQ5SUR0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PfasQ5SUR0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PfasQ5SUR0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PfasQ5SUR0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PfasQ5SUR0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PfasQ5SUR0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PfasQ5SUR0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PfasQ5SUR0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PfasQ5SUR0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PfasQ5SUR0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PfasQ5SUR0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PfasQ5SUR0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PfasQ5SUR0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PfasQ5SUR0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PfasQ5SUR0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PfasQ5SUR0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PfasQ5SUR0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PfasQ5SUR0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PfasQ5SUR0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PfasQ5SUR0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PfasQ5SUR0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PfasQ5SUR0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PfasQ5SUR0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PfasQ5SUR0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PfasQ5SUR0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PfasQ5SUR0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PfasQ5SUR0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PfasQ5SUR0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PfasQ5SUR0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PfasQ5SUR0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PfasQ5SUR0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PfasQ5SUR0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PfasQ5SUR0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PfasQ5SUR0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PfasQ5SUR0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PfasQ5SUR0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PfasQ5SUR0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PfasQ5SUR0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PfasQ5SUR0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PfasQ5SUR0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms