Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ankrd40Q5SUE8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ankrd40Q5SUE8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ankrd40Q5SUE8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms